MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium populi BJ001 plasmid pMPOP01

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010727	GACG	2	8	64	71	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010727	GGA	2	6	90	95	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010727	TCG	2	6	110	115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010727	CCGC	2	8	117	124	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_010727	GCC	2	6	174	179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010727	GAG	2	6	247	252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010727	CAC	2	6	256	261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010727	ATGC	2	8	262	269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010727	CTC	3	9	319	327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_010727	CGA	2	6	351	356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010727	GGC	2	6	432	437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010727	GCTCC	2	10	462	471	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_010727	GTC	2	6	523	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010727	CCG	2	6	597	602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_010727	CGC	2	6	700	705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010727	GGC	2	6	717	722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010727	GCC	2	6	724	729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010727	CGA	2	6	750	755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010727	GCGG	2	8	777	784	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010727	AGT	2	6	789	794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010727	GGCAAA	2	12	832	843	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010727	GAA	2	6	856	861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010727	GGC	2	6	895	900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010727	GGC	2	6	988	993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010727	GCGA	2	8	1176	1183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010727	TCGGGT	2	12	1185	1196	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010727	TCC	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010727	CCG	2	6	1282	1287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010727	TCAT	2	8	4871	4878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010727	GCGCA	2	10	4897	4906	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_010727	ATG	2	6	4947	4952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010727	CGA	2	6	9188	9193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010727	GTC	2	6	10030	10035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010727	CAT	2	6	10042	10047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010727	CGG	2	6	10068	10073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010727	AGC	2	6	10090	10095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010727	GGAA	2	8	10128	10135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010727	ACA	2	6	10171	10176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010727	CTCGC	2	10	10228	10237	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_010727	GCG	2	6	10343	10348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010727	GACC	2	8	10642	10649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010727	GCCG	2	8	10652	10659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010727	GTG	2	6	10662	10667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010727	GGT	2	6	10683	10688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010727	CGT	2	6	10692	10697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010727	GCG	2	6	10757	10762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010727	AAC	2	6	10777	10782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010727	AAAT	2	8	10887	10894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010727	CAT	2	6	10932	10937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010727	GATG	2	8	10945	10952	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010727	GGTC	2	8	10984	10991	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010727	AC	3	6	11053	11058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010727	GAAG	2	8	11126	11133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010727	ACC	2	6	11141	11146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_010727	GCT	2	6	11156	11161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010727	GTC	2	6	11165	11170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010727	GCCG	2	8	11253	11260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010727	ACCGC	2	10	11338	11347	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_010727	CCGG	2	8	12132	12139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010727	GC	3	6	12981	12986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010727	CCG	2	6	13111	13116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010727	GGC	2	6	13237	13242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010727	CCG	2	6	13261	13266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010727	GCCT	2	8	13268	13275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010727	GCG	2	6	13342	13347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010727	GCC	2	6	13419	13424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010727	GA	3	6	13442	13447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010727	CTA	2	6	13477	13482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010727	CCT	2	6	14061	14066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010727	TAG	2	6	14175	14180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010727	GGTCA	2	10	15471	15480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010727	CGG	2	6	15529	15534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010727	CAA	2	6	15551	15556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010727	ATC	2	6	15576	15581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010727	AT	3	6	15669	15674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010727	TCA	2	6	17034	17039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010727	CA	3	6	17038	17043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010727	GCT	2	6	17057	17062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010727	AT	3	6	17114	17119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010727	CGG	2	6	17143	17148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010727	AGC	2	6	17156	17161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010727	GCC	2	6	17168	17173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010727	GC	3	6	17201	17206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010727	CG	3	6	17338	17343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010727	AAC	2	6	17358	17363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010727	GCA	2	6	17392	17397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010727	GAC	2	6	17426	17431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010727	TCCGCC	2	12	17475	17486	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010727	CACTC	2	10	17498	17507	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_010727	GC	3	6	17568	17573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010727	CGGG	2	8	17586	17593	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010727	GCCGT	2	10	17605	17614	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010727	GCA	2	6	17620	17625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010727	TAGGG	2	10	20767	20776	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010727	CCA	2	6	20882	20887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010727	GCGG	2	8	22615	22622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010727	GTC	2	6	23201	23206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010727	AAC	2	6	23270	23275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010727	TGAG	2	8	23336	23343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010727	TTA	2	6	23639	23644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010727	CTG	2	6	23771	23776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.